Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nptx1Q62443 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nptx1Q62443 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms