Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgfbr2Q62312 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tgfbr2Q62312 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms