Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock1Q62288 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock1Q62288 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms