Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Kdm5dQ62240 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm5dQ62240 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Kdm5dQ62240 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms