Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sin3bQ62141 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms