Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrn1Q61809 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Lrrn1Q61809 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrn1Q61809 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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