Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd55bQ61476 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms