Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamb3Q61087 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamb3Q61087 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamb3Q61087 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamb3Q61087 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamb3Q61087 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamb3Q61087 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms