Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NinQ61043 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NinQ61043 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NinQ61043 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NinQ61043 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NinQ61043 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinQ61043 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NinQ61043 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NinQ61043 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NinQ61043 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NinQ61043 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NinQ61043 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NinQ61043 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NinQ61043 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms