Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JrkQ60976 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JrkQ60976 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms