Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rbbp7Q60973 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp7Q60973 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms