Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Meis1Q60954 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Meis1Q60954 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms