Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep250Q60952 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cep250Q60952 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep250Q60952 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms