Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DbpQ60925 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DbpQ60925 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DbpQ60925 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms