Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfrsf8Q60846 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms