Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r1bQ60829 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r1bQ60829 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms