Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf3Q60803 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Traf3Q60803 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Traf3Q60803 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms