Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf3Q60765 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atf3Q60765 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf3Q60765 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms