Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a1Q60737 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnk2a1Q60737 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms