Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprnQ60673 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprnQ60673 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PtprnQ60673 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprnQ60673 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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