Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prdm1Q60636 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm1Q60636 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm1Q60636 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms