Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sin3aQ60520 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sin3aQ60520 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms