Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rabl6Q5U3K5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabl6Q5U3K5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms