Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d9bQ5SVR0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d9bQ5SVR0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms