Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40Q5SUE8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms