Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sco1Q5SUC9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms