Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf215Q5SPX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf215Q5SPX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms