Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scarf1Q5ND28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf1Q5ND28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms