Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim58Q5NCC9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim58Q5NCC9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms