Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AY761185Q5ERI8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AY761185Q5ERI8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms