Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prkaa1Q5EG47 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prkaa1Q5EG47 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms