Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q5EBG8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q5EBG8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q5EBG8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms