Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtl5Q5DTT4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl5Q5DTT4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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