Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnl1Q52KE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnl1Q52KE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms