Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C2cd3Q52KB6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C2cd3Q52KB6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms