Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otol1Q4ZJM7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otol1Q4ZJM7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms