Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc84Q4VA36 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc84Q4VA36 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms