Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc27a5Q4LDG0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms