Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem171Q4KL18 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms