Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430531B16RikQ3V2J1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
6430531B16RikQ3V2J1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms