Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ckap2Q3V1H1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ckap2Q3V1H1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ckap2Q3V1H1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms