Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rbm44Q3V089 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rbm44Q3V089 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms