Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc27Q3V036 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms