Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SvipQ3UZP4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SvipQ3UZP4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms