Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnaaf3Q3UYV8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnaaf3Q3UYV8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms