Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc160Q3UYG1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc160Q3UYG1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms