Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clpsl2Q3UW21 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clpsl2Q3UW21 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms