Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lgr6Q3UVD5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lgr6Q3UVD5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms