Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fchsd2Q3USJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fchsd2Q3USJ8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms