Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc190Q3URK1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms